宝应卫生事业持续发展，已建成国家卫生城市、省初级卫生保健先进县，通过了省级卫生城和省环境综合整治优秀县城验收,现有各类卫生机构38个，其中医院、卫生院33个，拥有病床1294张。共有卫生技术人员2024人，其中医生899人；拥有中西医师605人、护师和护士559人、卫生防疫和防治人员79人。卫生工作多次获得省市表彰，县人民医院在全省率先跨入二等甲级医院行列。